Большое Янисъярви расположено в юго-западной части Карелии и относится к бассейну Ладожского озера. Площадь водной поверхности равна 174,9 кв. км, общая площадь (с островами) составляет 176,4 кв. км. Наибольшая длина 18,2 км, наибольшая ширина 15 км. Число островов – 43. Озеро овальной формы, несколько вытянуто с севера на юг. С западной стороны с озером соединяются два больших залива: Киркколахти и Контиолеппялахти, с южной – тоже два залива (Ораванниеменлахти и Ульмалахти). Берега преимущественно каменистые, возвышенные, большей частью покрыты лесом; местами встречаются скалистые берега. В озеро впадает не менее 20 небольших речек и ручьев. В южном конце из озера вытекает порожистая р. Янисъйоки, впадающая в Ладожское озеро. Озеро Большое Янисъярви - довольно глубокий водоем; средняя его глубина 11,6 м, наибольшая - 57 м. В Большом Янисъярви обитает 14 видов рыб: лосось, ряпушка, сиг, корюшка, щука, плотва, язь, лещ, уклея, гольян, угорь, налим, окунь, ерш.