Река Уксунйоки расположена в южной части Карелии. Образуется в месте слияния рек Сяреннюсйоки и Кюйккайоки, причем последняя фактически является истоком реки. Кюйккайоки вытекает из озера Кюйккаярви. Впадает река в Ладожское озеро около станции Ууксу. В отличие от большинства карельских рек, Уксунйоки на всем своем протяжении, исключая первые 8 км, течет в своем русле и не является цепочкой озер, соединенных порожистыми протоками. Населенных пунктов на берегах реки нет, за исключением тех деревень, которые используются как начальный и конечный пункты маршрута.